Eksistensi Fakultas Dakwah UIN Prof. K.H. Saifuddin Zuhri (UIN Saizu) diawali dengan berdirinya Jurusan Dakwah STAIN Purwokerto pada Tahun 1997 yang didasarkan pada komitmen untuk memberikan warna dan kontribusi terhadap pengembangan dakwah Islam, baik secara teoritis maupun praktis. Upaya itu dilakukan dengan mempersiapkan para ahli dan praktisi di bidang dakwah yang mampu menguasai berbagai pendekatan baik melalui lisan, tulisan, maupun perbuatan nyata.